Высшим органом управления Ассоциации является Общее собрание членов Ассоциации, которое осуществляет общее руководство деятельностью Ассоциации, определяет цели и стратегию ее развития.

В период между Общими собраниями высшим органом управления является Совет Ассоциации, который избирается Общим собранием из числа представителей членов Ассоциации сроком на 3 года.

Руководит деятельностью Совета и организует его работу Председатель Совета Ассоциации, избираемый на заседании Совета из числа членов Совета открытым голосованием.

С декабря 2003 года Председателем Совета Ассоциации является Рутковский Александр Евгеньевич – Председатель Правления ОАО «Белинвестбанк».

В настоящее время в состав Совета Ассоциации входят:

• Рутковский А.Е. – Председатель Совета Ассоциации
  Председатель Правления ОАО «Белинвестбанк»
• Иванов В.В.
  Председатель Правления ЗАО Банк ВТБ (Беларусь)
• Каллаур П.В.
  Председатель Правления ОАО «Белвнешэкономбанк»
• Катибников И.В.
  Председатель Правления ЗАО «АКБ «Белросбанк»
• Кухоренко Г.П.
  Председатель Ассоциации белорусских банков
• Матюшевский В.С.
  Председатель Правления ОАО «БПС-Сбербанк»
• Назаренко В.А.
  Заместитель Председателя Правления ОАО «АСБ Беларусбанк»
• Никанорова Л.В.
  Исполнительный директор «Приорбанк» ОАО
• Подковыров В.И.
  Председатель Правления ОАО «Белагропромбанк»
  

Возглавляет Ассоциацию Председатель Ассоциации, который избирается Общим собранием сроком на 3 года и входит в состав Совета Ассоциации. Председатель Ассоциации осуществляет повседневное оперативное руководство деятельностью Ассоциации и представляет ее во взаимоотношениях с государственными, общественными и иными органами и организациями.

В апреле 2011 г. Председателем Ассоциации белорусских банков избрана
Галина Петровна Кухоренко.
 

При Ассоциации созданы и функционируют на общественных началах комитеты по основным направлениям банковской деятельности:

• валютный комитет
• комитет по предотвращению легализации преступных доходов и финансирования терроризма
• юридический комитет
• комитет по информационным технологиям
• комитет по банковскому маркетингу
• комитет платежной системы
• комитет по управлению рисками
• комитет аудиторов
• налоговый  комитет
• комитет по бухгалтерскому учету и расчетам

а также:

• рабочая группа по вопросам внедрения новых пруденциальных требований Национального банка Республики Беларусь